BioAI 生命科学日报 2026/3/24
今日摘要
DeepMind 伦敦新楼命名 Platform 37,底层开 AI 科普馆让普通人也能看懂前沿技术。
AlphaFold3 开始设计 CAR-T 专用激活剂,长读测序用甲基化信号提升基因分型准确率。
AI 制药工具越来越接地气,生物技术创业者值得关注蛋白质设计赛道。⚡ 快速导航
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今日 AI 生命科学资讯
👀 只有一句话
AlphaFold 团队在伦敦建了座新楼,底层还要开 AI 科普馆。
🔑 3 个关键词
#AI蛋白质设计 #AI医疗诊断 #AI药物发现
🔥 重磅 TOP 10
DeepMind 新总部 Platform 37 落地伦敦,致敬 AlphaGo Move 37
Demis Hassabis 宣布 Google DeepMind 在伦敦的新大楼正式命名为 Platform 37,这个名字来自 AlphaGo 对战李世石时那步"神之一手"。大楼底层还会开放一个叫"AI Exchange"的公共空间,办展览、搞活动,让普通人也能了解 AI。今年晚些时候就能去参观了。DeepMind 在伦敦扎根更深,下一个 AlphaFold 级别的突破可能就在这栋楼里诞生。
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基于 Swin Transformer 的乳腺癌诊断深度学习框架
乳腺癌诊断一直依赖医生肉眼看片,误诊率不低。这篇 Nature 子刊论文提出了一个结合 Swin Transformer 和双注意力多尺度融合网络的深度学习框架,能自动分析医学影像,提高诊断准确率。Swin Transformer 擅长捕捉图像的局部和全局特征,双注意力机制则能聚焦关键病灶区域。这套系统如果落地,能帮医生更快更准地筛查乳腺癌,尤其在医疗资源不足的地区。
LongHap:利用长读测序甲基化信号改进变异分型
基因测序不只是读 ATCG 四个字母,还要搞清楚哪些碱基来自爸爸、哪些来自妈妈(这叫"分型")。传统方法只看序列变异,容易出错。LongHap 这个新工具聪明在哪?它把 PacBio 和 ONT 长读测序自带的甲基化信号也用上了——甲基化模式在父母染色体上不一样,能当"路标"帮助分型。测试显示,LongHap 的错误率比 WhatsHap、HapCUT2 这些老工具低,还能处理医学上重要的复杂基因区域。对临床基因检测和遗传病诊断来说,这是个实打实的进步。
DEX:基于共识的氨基酸可交换性度量
氨基酸之间的"相似度"决定了蛋白质进化时哪些突变更容易发生。但现有的 30 多种氨基酸距离度量标准各说各话,没人知道哪个最准。这项研究测试了所有主流度量方法,还开发了一个基于深度突变扫描数据的新度量 DEX。结果显示,实验数据驱动的方法(比如 EX 和新开发的度量)最能预测真实的氨基酸替换模式。DEX 是这些顶尖方法的"共识版本",在跨物种测试中表现最好。对蛋白质工程、药物设计、进化分析来说,选对度量标准能让模型更准确。
用 AlphaFold3 和物理机器学习设计 CAR-T 细胞专用 IL-2 激活剂
CAR-T 疗法治疗癌症效果不错,但需要 IL-2 这种细胞因子来"喂养"免疫细胞。问题是,普通 IL-2 会激活所有免疫细胞,包括抑制免疫反应的调节性 T 细胞(Tregs),还会引发严重副作用。这项研究用 AlphaFold3 预测蛋白质结构,结合物理约束的序列生成器,设计出了只激活 CAR-T 细胞、不激活其他细胞的"正交"IL-2 变体。计算结果显示,这些变体与目标受体结合良好(ipTM 平均 0.724),与非目标受体几乎不结合(ipTM <0.5)。如果实验验证成功,CAR-T 疗法的安全性和疗效都能大幅提升。
新型苯并咪唑-烷磺酸盐偶联物作为胆碱酯酶抑制剂
阿尔茨海默病的一个治疗思路是抑制胆碱酯酶,提高大脑中乙酰胆碱的水平。这篇论文合成了一系列新型苯并咪唑-烷磺酸盐偶联物,通过体外实验和计算机模拟验证了它们的抑制活性。这类化合物结构新颖,可能成为新一代阿尔茨海默病药物的候选分子。不过从实验室到临床还有很长的路要走。
基于序列数据分析和数据挖掘的痴呆症早期诊断预测模型
痴呆症早期诊断难,等症状明显时往往已经晚了。这项研究用机器学习分析患者的序列数据(比如认知测试、生物标志物随时间的变化),建立了一个早期预测模型。模型能在症状出现前识别高风险人群,为早期干预争取时间。数据挖掘技术在医疗领域的应用越来越广,这类工具未来可能成为常规体检的一部分。
设计靶向补体 C9 的微型蛋白抑制剂,阻断膜攻击复合物组装
补体系统是免疫系统的一部分,但过度激活会导致自身免疫疾病。膜攻击复合物(MAC)是补体系统的"终极武器",能在细胞膜上打孔杀死细胞。这项研究设计了一种微型蛋白,能精准结合补体 C9,阻止 MAC 组装。微型蛋白比抗体小得多,更容易进入组织,稳定性也更好。这为治疗补体相关疾病(如视神经脊髓炎、阵发性睡眠性血红蛋白尿症)提供了新思路。
MSCMF-DTB:多尺度跨模态融合框架用于药物-靶点结合预测
药物研发的第一步是找到能结合疾病靶点的分子。传统方法要在实验室里一个个测试,费时费力。MSCMF-DTB 这个框架用深度学习融合药物和蛋白质的多尺度特征(序列、结构、化学性质),预测它们能不能结合。“跨模态"是指同时处理不同类型的数据(比如文本序列和 3D 结构),“多尺度"是指从原子级到分子级的不同层次。这类工具能大幅加速药物筛选,降低研发成本。
环肽空间:覆盖全面物理性质的序列选择方法
环肽是下一代药物的热门候选——比小分子药物更稳定,比抗体更容易合成。但环肽的化学空间太大了,随机筛选效率低。这项研究用蛋白质语言模型 ESM-2 建立了一个"环肽空间”,把每个环肽映射成高维向量,向量之间的距离反映物理化学性质的差异。在这个空间里均匀采样,能更高效地覆盖不同性质的环肽。实验证明,用这种方法设计的 β2-微球蛋白结合肽,比随机选择的效果好得多。这为 AI 驱动的环肽药物设计提供了新框架。
📌 值得关注
[研究] AI 数据科学家的 Agent 基础循环 - 这篇文章解释了 AI Agent 的基本工作原理,适合数据科学家入门
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