BioAI 生命科学日报 2026/2/19
今日摘要
PocketXMol 登上 Cell,一个模型统一分子对接、从头设计、多肽生成,AI 制药工具箱添了把瑞士军刀。
冷冻电镜玩出新花样:跳过位姿恢复,直接从噪声图像预测原子坐标。基因组隐私问题也扎堆冒头。
工具整合是趋势,隐私保护是刚需,两条线都值得盯。⚡ 快速导航
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今日 AI 生命科学资讯
👀 只有一句话
DeepMind 掌门人 Demis Hassabis 跑去印度聊 AI for Science,顺便膜拜了拉马努金雕像。
🔑 3 个关键词
#AI分子设计 #冷冻电镜AI #临床决策AI
🔥 重磅 TOP 10
1. PocketXMol:一个模型搞定分子生成全流程
以前做药物设计,对接用一个模型,从头设计用另一个,肽类设计又换一个——光是切换工具就够头疼的。现在 Cell 发了篇论文,搞出一个叫 PocketXMol 的原子级生成式 AI,把对接、从头设计、小分子和多肽生成全部统一了。更关键的是,这不是纸上谈兵,实验验证都过了。AI 制药的工具箱,又多了一把瑞士军刀。
2. 冷冻电镜图像直接预测原子坐标,不用再算位姿了
冷冻电镜(cryo-EM)的老大难问题:图像噪声大、拍摄角度未知、蛋白质还在动。传统方法得先恢复位姿,再重建结构,费时费力。这篇 bioRxiv 预印本另辟蹊径——用卷积自编码器把图像压缩成潜在表示,再用回归网络直接预测原子坐标。腺苷酸激酶的全原子模型,RMSD 只有 2.11 Å。虽然还是合成数据验证,但思路很野,值得关注。
3. LLM Agent 做临床决策,到底行不行?Nature 子刊给了答案
大语言模型(LLM)能写代码、能聊天,但让它当医生做临床决策呢?Nature Digital Medicine 发了一篇 benchmark 研究,系统测试了基于 LLM 的 Agent 系统在临床决策任务上的表现。结论是:有潜力,但还不够稳。对于想把 AI Agent 塞进医院的团队来说,这篇论文是必读的"避坑指南"。
4. Demis Hassabis 印度行:AI for Science 的布道之旅
DeepMind CEO Demis Hassabis 跑去印度科学研究所(IISc Bangalore),和教授们聊 AI for Science。他说印度年轻人对 AI 的热情让他印象深刻,还特意去看了数学天才拉马努金的雕像。这趟行程信号很明确:AI for Science 的下一波浪潮,印度是重要玩家。

5. 婴儿肠道菌群的全球基因组图谱:益生菌设计有了新蓝图
婴儿双歧杆菌(B. infantis)对婴儿肠道健康至关重要,但现有益生菌产品里的菌株,和真实婴儿肠道里的菌株差得远。Cell 这篇论文做了全球范围的基因组调查,发现低收入国家婴儿肠道里的 B. infantis 多样性很高,但西方国家几乎没有。这份基因组和菌株库,为设计"因地制宜"的婴儿益生菌提供了蓝图。
6. 纳米孔测序直接把耐药基因和病原菌对上号
宏基因组测序能直接从临床样本里检测病原体和耐药基因,但问题是:这个耐药基因到底是哪个细菌的?这篇预印本用纳米孔测序的 DNA 甲基化模式来解决这个问题,在碳青霉烯耐药肠杆菌的模拟样本上达到了 91% 的物种级准确率。对医院感染监测来说,这是个实用的新工具。
7. 肝脏运动因子逆转衰老和阿尔茨海默相关的记忆丧失
运动对大脑好,这谁都知道。但具体是怎么好的?Cell 这篇论文找到了一个关键分子:肝脏分泌的运动因子 GPLD1。它能修复血脑屏障,逆转衰老和阿尔茨海默模型中的认知损伤。机制是靶向脑血管内皮细胞上的 GPI 锚定蛋白。“运动是良药"这句话,现在有了分子级的解释。
8. 全脑少突胶质细胞图谱:髓鞘损伤的区域差异一目了然
少突胶质细胞负责给神经元"包电线”(形成髓鞘),但不同脑区的髓鞘丰度、修复能力、损伤易感性差异巨大。Cell 这篇论文构建了跨年龄、疾病、性别、品系的全脑少突胶质细胞图谱,整合了转录组和超微结构数据。对于研究多发性硬化等脱髓鞘疾病的人来说,这是一份宝贵的资源。
9. 隐私保护的泛基因组图谱:想贡献基因组又怕被认出来?
人类泛基因组参考图谱能捕捉群体遗传多样性,但公开个人单倍型有隐私风险——可能被重新识别身份或推断敏感特征。PanMixer 框架来了:它选择性地混淆个人单倍型,同时保留参考图谱的实用性。用 47 人的泛基因组测试,重新识别风险大幅降低,下游分析(等位基因频率、连锁不平衡、读段比对)准确性不受影响。
10. 多基因风险评分的隐私泄露:一个 PRS 值能暴露多少基因信息?
多基因风险评分(PRS)越来越多地用于临床和消费级基因检测,但公开分享 PRS 值的隐私风险被严重低估了。这篇预印本展示了如何从单个 PRS 值反推基因型,甚至在基因组数据库中重新识别个人身份。研究者还提供了评估隐私风险的分析框架和解决方案。想用 PRS 的,先看看这篇。
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[研究] 联邦学习+轻量注意力CNN检测白血病 - 隐私保护+分布式医学影像,两个热点一锅端
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| # | 类型 | 标题 | 链接 |
|---|---|---|---|
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🔮 AI生命科学趋势预测
AI 分子生成工具整合潮
- 预测时间:2026年Q2
- 预测概率:70%
- 预测依据:今日新闻 PocketXMol 统一分子生成任务 + 近期多个 AI 制药公司都在做工具整合,“一站式平台"是明显趋势
冷冻电镜 AI 重建方法突破
- 预测时间:2026年3-4月
- 预测概率:55%
- 预测依据:今日新闻 图像直接预测原子坐标 + 结构生物学领域对端到端方法的需求强烈,预计会有更多团队跟进
基因组隐私保护成为监管焦点
❓ 相关问题
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