BioAI 生命科学日报 2026/2/9
今日摘要
机器学习从宏基因组里挖出CRISPR-Cas9的新PAM序列，基因编辑工具箱又扩容了。
开源健康AI扎堆上线，从养猪到养老全覆盖，数据隐私党终于有本地方案了。
今天适合收藏，OpenHealth和HealthChain两个项目值得跑一遍。⚡ 快速导航
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今日 AI 生命科学资讯
👀 只有一句话
今天开源圈扎堆搞健康AI，从养猪到养老全覆盖，但真正硬核的是那个挖掘CRISPR新玩法的机器学习研究。
🔑 3 个关键词
#AI健康管理 #CRISPR机器学习 #开源医疗
🔥 重磅 TOP 10
1. 机器学习挖出CRISPR-Cas9的"隐藏菜单"
做基因编辑的朋友都知道，Cas9认不认你的靶点，全看PAM序列对不对。以前大家只知道几种常见的PAM，就像只会点招牌菜。现在这篇Nature Communications的研究，用机器学习从海量宏基因组数据里"淘金"，挖出了一大堆新的PAM序列。这意味着什么？以前编辑不了的位点，现在可能有戏了。基因治疗的工具箱又厚了一层。
2. OpenHealth：3800星的开源健康AI助手
想象一下，你的健康数据不用交给任何公司，全存在自己电脑上，还能用AI帮你分析。OpenHealth就是干这个的。3800+星的热度说明大家对"数据隐私+AI健康"这个组合有多渴望。支持本地运行，想用哪个AI模型自己选。对隐私敏感又想玩AI健康管理的朋友，这个值得收藏。
3. HealthChain：医疗AI的"中间件"来了
做过医疗AI开发的都懂，最头疼的不是模型，是怎么把AI塞进医院那套老系统里。HealthChain定位就是这个"中间层"——帮你把AI能力和医疗系统对接起来。虽然星数不算爆炸，但解决的是真痛点。想在医疗场景落地AI的团队，可以关注一下。
4. DeepPurpose：药物-靶点预测的瑞士军刀
做AI制药的同学应该不陌生。DeepPurpose是个深度学习工具包，专门搞药物-靶点相互作用（DTI）、药物性质预测、蛋白质功能预测这些活儿。1100+星，文档齐全，适合想快速上手AI制药的新人。老手也能拿来当baseline跑实验。
5. 生猪健康智慧医药系统：RAG+大模型养猪
没看错，这是个用RAG（检索增强生成）+DeepSeek大模型做的"AI兽医"系统。养殖户拍张照，AI帮你判断猪生了啥病、该用啥药。虽然听起来有点土味，但农业AI+生命科学的交叉，市场空间可不小。技术栈也挺新：SpringBoot3 + Spring AI + Ollama。
6. Awesome Healthcare AI Agents：医疗AI Agent资源大全
最近Agent概念火得一塌糊涂，医疗领域也不例外。这个repo收集了医疗AI Agent的最新进展，论文、项目、工具一网打尽。想追这个方向的，先把这个收藏了再说。
7. SemiBin：宏基因组分箱的深度学习新选择
搞宏基因组的朋友都知道，分箱（binning）是个老大难。SemiBin用自监督深度学习来做这件事，效果比传统方法好不少。虽然小众，但对微生物组研究来说是个实用工具。
8. ClairS：长读长测序的体细胞变异检测利器
做肿瘤基因组的都知道，体细胞小变异检测是个技术活。ClairS专门针对长读长测序（比如PacBio、Nanopore）优化，用深度学习提升检测准确率。港大出品，值得一试。
9. ProteinFlow：蛋白质结构数据的深度学习预处理流水线
想用深度学习做蛋白质设计，数据预处理是第一道坎。ProteinFlow帮你把PDB结构数据处理成模型能吃的格式，省去大量脏活累活。Adaptyv Bio出品，专业靠谱。
10. DANCE：单细胞分析的深度学习基准平台
单细胞测序数据越来越多，分析方法也五花八门。DANCE提供了一个统一的深度学习库和benchmark平台，方便大家比较不同方法的效果。做单细胞AI的，这个必收。
📌 值得关注
- [开源] Lotti：本地优先的AI健康助手 - 数据全存本地，隐私党狂喜
- [开源] SparkyFitness：家庭健康追踪AI - 全家一起用，食物、运动、饮水全管
- [开源] WellAlly-Health：Claude驱动的健康助手 - 症状记录、用药管理、多学科会诊一条龙
- [开源] Open-Wearables：可穿戴设备数据统一API - 自托管，AI-ready，数据整合神器
- [开源] Awesome Healthcare Datasets - 医疗AI数据集大全，找数据先看这里
- [研究] 计算优化DEK1蛋白溶解度 - 结构建模+数据驱动突变，蛋白质工程新思路
- [研究] 天然化合物抗肺炎克雷伯菌的计算筛选 - 多靶点药物发现的AI辅助案例
📊 更多动态
| # | 类型 | 标题 | 链接 |
|---|---|---|---|
| 1 | 开源 | TransformerCPI：化合物-蛋白质相互作用预测 | GitHub |
| 2 | 开源 | DeepMicrobes：宏基因组物种分类 | GitHub |
| 3 | 开源 | Deep Learning in Bioinformatics资源合集 | GitHub |
| 4 | 开源 | Doctor-Dok：医疗数据AI解析框架 | GitHub |
| 5 | 开源 | TalkHeal：AI心理健康支持助手 | GitHub |
| 6 | 开源 | Hia：血液报告AI分析Agent | GitHub |
😄 AI生命科学趣闻
养猪也要用RAG+大模型了
今天最接地气的AI项目：有人用RAG+DeepSeek大模型做了个"AI兽医"，专门给猪看病。拍张照，AI告诉你猪得了啥病、该吃啥药。网友评论：“以后猪都比我先用上大模型了。” 😂 不过说真的，农业AI这块确实是蓝海。
🔮 AI生命科学趋势预测
CRISPR-Cas9 PAM多样性研究将催生新型基因编辑工具
- 预测时间：2026年Q2
- 预测概率：70%
- 预测依据：今日新闻 机器学习挖掘Cas9 PAM多样性 + 基因编辑领域对新型PAM识别工具的需求持续增长
开源健康AI项目将迎来整合潮
- 预测时间：2026年Q1-Q2
- 预测概率：60%
- 预测依据：今日多个开源健康AI项目（OpenHealth、Lotti、WellAlly等）功能高度重叠，市场可能出现整合或标准化趋势
医疗AI Agent将进入临床试点
- 预测时间：2026年Q2
- 预测概率：55%
- 预测依据：今日新闻 Awesome Healthcare AI Agents + Agent技术成熟度提升，医疗场景落地加速
❓ 相关问题
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今日AI生命科学领域的热点包括：机器学习挖掘CRISPR-Cas9新PAM序列、OpenHealth开源健康AI助手、HealthChain医疗AI中间件。想要持续追踪这类AI + 生命科学交叉领域的前沿动态？
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