BioAI 生命科学日报 2026/2/4
今日摘要
DNABERT框架让转录因子结合位点预测更准,做基因调控研究的可以省不少实验成本。
蛋白质稳定性预测、医学AI跨场景部署、衰老时钟神经保护——今天的论文都在解决"落地难"。
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今日 AI 生命科学资讯
👀 只有一句话
今天最值得关注的:一个基于DNABERT的深度学习框架,让转录因子结合位点预测变得更准了。
🔑 3 个关键词
#AI基因组学 #蛋白质稳定性预测 #医学AI
🔥 重磅 TOP 10
1. 基于DNABERT的深度学习框架预测转录因子结合位点
做基因调控研究的朋友都知道,找转录因子结合位点有多头疼——实验成本高、周期长。现在这个框架把DNABERT(一种专门理解DNA序列的预训练模型)用到了结合位点预测上,相当于给DNA序列装了个"翻译器"。对做基因编辑、药物靶点筛选的团队来说,这可能是个省时省力的好工具。
2. JanusDDG:基于物理信息的神经网络预测蛋白质稳定性
蛋白质工程师的老难题:改了一个氨基酸,蛋白质会不会直接"塌房"?JanusDDG用了一种叫"双面注意力"的机制,只需要序列信息就能预测突变对稳定性的影响。不用跑分子动力学模拟,不用等实验结果。做抗体设计、酶工程的可以关注一下。
3. 医学AI如何跨临床场景扩展?Nature Medicine发文讨论
一个AI模型在A医院效果很好,换到B医院就拉胯——这事儿太常见了。这篇文章讨论的就是医学AI的"水土不服"问题:数据分布不同、设备差异、患者群体变化……作者提出了一些扩展策略。做医疗AI产品的,建议细读。
4. 人机协作提升肿瘤临床试验筛选效率:随机对照试验结果
筛选临床试验患者有多累?一个护士可能要翻几百页病历才能确定一个人符不符合入组标准。这项研究用AI辅助人工筛选,结果显示准确率和效率都提升了。关键是——这是个随机对照试验,不是PPT里的demo。
5. 衰老时钟揭示哪些神经元更容易退化,哪些更抗打
为什么有些神经元在衰老过程中先"倒下",有些却能撑到最后?研究团队用衰老时钟(一种基于表观遗传学的生物年龄测量工具)分析了不同神经元类型,还找到了一些可能的神经保护干预靶点。做神经退行性疾病研究的,这篇值得一看。
6. 单细胞多组学图谱揭示人脑转录和染色质状态
75万个细胞核、18个脑区、160种细胞类型——这是目前最大规模的人脑单细胞多组学图谱之一。研究团队同时测了转录组和组蛋白修饰,还整合了染色质可及性、DNA甲基化、3D基因组结构数据。对神经精神疾病的非编码变异解读,这个资源库可能会很有用。
7. DeepPurpose:药物-靶点相互作用预测的深度学习工具包
做AI制药的应该对这个工具不陌生了——它能预测药物-靶点相互作用(DTI)、药物性质、蛋白质-蛋白质相互作用等。GitHub上1125颗星,说明社区认可度不错。如果你在做虚拟筛选或靶点发现,可以试试。
8. StructSAM:结构感知的肺癌病灶CT分割方法
SAM(Segment Anything Model)很强,但直接用在医学影像上效果一般。这个工作针对肺癌CT分割做了结构感知的适配,让模型更懂"肺"的解剖结构。做医学影像AI的可以参考这个思路——通用大模型+领域适配。
9. 多倍体心肌细胞定义心脏病的特异性转录状态
心脏受伤后,心肌细胞会变成多倍体(基因组加倍),这被认为是心脏再生的障碍。这项研究整合了人、大鼠、小鼠的单细胞和空间多组学数据,发现多倍体心肌细胞有独特的代谢和染色质重塑程序,而且富集了一些心衰治疗靶点。有意思的是,他们还发现TNIK抑制剂能改善大鼠心梗后的心功能。
10. OpenHealth:开源的AI健康助手
一个开源项目,3800+星。它的卖点是"由你的数据驱动"——你可以把自己的健康数据喂给它,然后用AI来分析。隐私敏感的用户可能会喜欢这种本地化方案。不过要注意,AI健康建议不能替代医生诊断。
📌 值得关注
[研究] 个性化ctDNA分析检测头颈癌术后残留病灶 - 液体活检在肿瘤监测上又进一步
[研究] 快速灵活的多性状精细定位方法 - GWAS分析的新工具,速度更快
[研究] 用表观遗传数据预测基因组突变率变异 - 染色质状态如何影响突变?这篇有答案
[开源] Awesome-AI-Agents-for-Healthcare - 医疗AI Agent资源汇总,610星
[开源] HealthChain:医疗AI的中间件层 - 做医疗AI集成的可以看看
[开源] SemiBin:基于自监督深度学习的宏基因组分箱 - 微生物组研究工具
📊 更多动态
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| 5 | 开源 | ClairS:长读长体细胞小变异检测深度学习方法 | 链接 |
| 6 | 开源 | TransformerCPI:基于Transformer的化合物-蛋白质相互作用预测 | 链接 |
| 7 | 开源 | DANCE:单细胞分析深度学习库 | 链接 |
🔮 AI生命科学趋势预测
AlphaFold系列将发布蛋白质动力学预测功能
- 预测时间:2026年Q2
- 预测概率:55%
- 预测依据:今日新闻 JanusDDG蛋白质稳定性预测 显示序列到功能模型正在快速发展 + DeepMind历史上倾向于在蛋白质结构预测基础上扩展功能
医疗AI监管框架将在多国更新
- 预测时间:2026年Q1-Q2
- 预测概率:70%
- 预测依据:今日新闻 医学AI跨场景扩展讨论 反映了行业对标准化的需求 + 各国监管机构正在加速AI医疗器械审批流程制定
单细胞多组学数据库将出现整合平台
- 预测时间:2026年Q1
- 预测概率:65%
- 预测依据:今日新闻 人脑单细胞多组学图谱 等大规模数据集发布 + 数据整合需求日益迫切
❓ 相关问题
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